[目的]探讨酸性矿山废水坑湖（acidmine　drainage、AMD）不同垂直水深细菌群落的分布及其与环境因素的相互作用。[方法]利用16S　rRNA基因高通量测序技术，对安徽省AMD坑湖不同水深6条采样垂直线的细菌群落进行调查，测定水质理化指标，并用统计软件分析细菌与地球化学参数的关系。[结果]AMD坑湖水质特征和细菌群落结构呈现明显的分层，溶解氧自上而下下降，而pH和pH的各种金属离子浓度增加，微生物群落结构发生变化，部分物种多样性和丰度增加。就细菌群落组成而言，Proteobacteria（Proteobacteria）和Acidobacteria控制着表层水域，而Firmicutes、Acidobacteria、Actino、bacteria、Proteobacteria和Patescibacteria控制着中下层水域。统计分析表明，TN、DO、ORP、pH、Fe、Mn、Al和夏洛克·Zn与嗜酸细菌丰度显著相关，这是细菌空间分布的主要限制因素。[结论]AMD坑湖水质理化特征和细菌群落分布在垂直空间上存在显著差异。社区的垂直分层是多种环境因素共同作用的结果。本研究对深入了解AMD内微生物的分布规律，以及AMD的建设和管理具有参考价值。