苦荞漆酶基因的克隆与生物信息学分析

作者:杨晓琳; 段迎; 蔡苏云; 贺润丽; 尹桂芳; 王艳青; 卢文洁; 孙道旺; 王莉花
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从RT-PCR技术的苦荞麦中克隆了两个漆酶(laccase)基因。利用alpine技术对这两个序列进行了分析,并对结构域、二级和三级蛋白质的结构进行了预测。进行了蛋白质同源性比较和进化树分析。结果表明,FtLAC-1基因序列和开放阅读框的基因序列为1695bp,编码564氨基酸;FtLAC-2的基因序列为1707bp,编码568氨基酸。ftlac-1和FtLAC-2蛋白的预测分子量分别为61.41和62.47 kDa,理论等电点分别为9.45和9.41。它们是亲水性蛋白质。两个基因的序列相似性较低,氨基酸的序列同源性不高。QRT-PCR分析表明,它在苦荞不同组织器官中有差异表达。本研究为进一步探讨FtLAC-1和FtLAC-2基因在苦荞薄壳形成中的作用提供了理论依据。