绵羊IGF1R基因多态性及其与生长性状的关联分析
[目的]探讨胰岛素样生长因子1受体(类insulin生长因子1、receptor、IGF1R)基因遗传变异对绵羊生长性状的影响,为培育优质肉羊新品种(系)提供有效参考。【方法】采用液相捕获测序技术获得了杜泊羊、小尾寒羊和滩羊91只绵羊的IGF1R基因变异位点,并筛选出具有显著种间差异的单核苷酸多态性(single、nucleotide polymorphism、SNP)位点。根据所选位点,用飞行质谱法检测了3个绵羊品种的383个杂交后代,并分析了它们与新生羊和3月龄羊生长性状的相关性。[结果]三个绵羊品种的IGF1R基因共检测到347个突变位点,包括外显子和SNPs的8个:g.7628315 T>C、g.7628528T>C、g.7628690 C>T、g.7833817 C>T、g.7836687 C>T、g.7840691 T>C、g.7855904 C>g、g.7872277 C>T,其他位点处于Hardy-Weinberg平衡。g、 7628528T>C和g.7872277 C>T基因座在三个绵羊群体中表现出低多态性(PIC<0.25)。7833817G.7833817 C>T位点在三个绵羊群体中表现出中度多态性(0.25<0.50)。其他五个基因座在一个或两个群体中表现出中度多态性。单基因座关联分析显示,G.7628528T>C基因座与3个月龄体重、F2代胸围和H2代新生儿胸围显著相关(P<0.05)H2一代的胸围显著相关(P<0.05)。7833817C>T位点与F2代3月龄身高显著相关(P<0.05)。G.7836687C>T位点与F1代3月龄体重、胸围、F2代3月龄身高显著相关(P<0.05),与F2代新生儿胸围显著相关(P<0.05)。G.7872277 C>T位点与H1代3月龄胸围、H2代新生儿体重、身高、胸围和3月龄身高显著相关(P<0.05),H2代3月龄身高显著相关(P<0.05)。G.7840691 T>C位点与生长性状无显著相关(P>0.05)。连锁不平衡分析发现,G.7628315 T>c-G.7628528 T>c和G.7833817 c>T-g.7840691 T>c形成了两个强连锁,并构建了三个单倍型。组合后形成6个基因型,其中优势基因型分别为h2h2和H5H6。发现单倍型h0的生长指数。05显著高于其他单倍型h0。05(P<0.05)。[结论]IGF1R基因遗传变异分店对绵羊生长性状有显著影响。8个SNPs基因座可作为绵羊生长发育过程中潜在的候选遗传标记。本研究结果可为IGF1R基因在肉羊的选种和育种提供重要参考,为分子标记辅助育种在肉羊的育种提供理论依据。