妃子笑荔枝LcSAI启动子的克隆及其生物信息学分析
作者:董晨; 李金枝; 郑雪文; 王弋; 李伟才
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[目的]酸性转化酶在荔枝糖代谢中起重要作用。对荔枝酸转化酶基因(LcSAI)的启动子进行了克隆和分析,为LcSAI荔枝糖代谢调控的功能研究提供理论依据。【方法】以妃子笑荔枝果肉为材料,根据荔枝基因组序列信息,克隆LcSAI上游约1500个bp的启动子序列,并用生物信息学工具预测和分析启动子序列中的转录起始位点、顺式作用元件和CpG岛。[结果]克隆了1514个bp的LcSAI启动子序列。除了大量启动子核心元件如TATA-box和增强元件CAAT-box外,启动子顺式作用元件还具有光反应顺式元件、激素应答元件、厌氧诱导反应元件、MYB结合位点、MYC结合位点和一些功能未知的顺式作用元件。LcSAI-启动子序列中可能有三个核心启动子地区,LcSAI启动子地区预计不会出现满足有限条件的CpG岛。[结论]LcSAI基因启动子与应激有关。推测酸性转化酶在荔枝抗逆性生理过程中起重要作用。