野蔷薇MATE基因的生物信息学分析
作者:陈锐; 徐瑶; 冯条红; 徐睆; 程文翰
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多药和有毒化合物外排家族(MATE)可以运输次级代谢物,如阳离子染料、氨基葡糖、多种抗生素和药物。通过比较模式生物拟南芥(Arabidopsis-thaliana)MATE家族蛋白的氨基酸序列和ROSA的数据库,获得了野生玫瑰(Rosa、multiflora Thunb)的三个MATE基因序列,分别命名为RmMATE1、RmMATE2和RmMATE。利用盛欣数据库分析了蛋白、结构域、亚细胞定位三个序列的物理特征和跨膜结构,分析了拟南芥AtMATE基因的表达模式,推测了RmMATE的表达模式。这为进一步探索野生玫瑰MATE家族基因的结构、功能和作用机制提供了有价值的数据。