为了了解酸性矿山废水排水区至水库底水细菌群落结构的变化，探讨其环境影响因素，2019年9月，采用高通量测序技术和主成分分析（主成分分析）方法，采集了12个受酸性矿山废水影响的水样（mine　drainageacid、AMD）。结果表明，仓储盆地水样中细菌群落多样性的变化趋势不明显，细菌多样性从表面到底部呈上升趋势。在门级，受AMD影响的细菌主要是变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes，0.21%~12.96%）、厚壁菌门（Firmicutes，0.15%~14.48%）和放线菌门（Actino、bacteria，0.06%~4.64%）—Proteus（Betaproteobacteria，1.29%~63.53%）和Proteus（Gamma、proteobacteria，6.41%~63.09%）是优势细菌。从不同空间位置的浮游细菌群落组成来看，不动杆菌属（不动杆菌）在受AMD影响的盆地上游至水库底部的水样中占很大比例，占2.13%~57.84%。假单胞菌属（Pseudomonas，3.86%-12.29%）、铁细菌（ferrovum，0.97%-13.21%）和拟杆菌属（Bacteroides，0.01%-5.02%）是上游水样中的优势菌，噬氢菌属（Hydrogenophaga，0-5.94%）、盖氏铁柄杆菌（Gallionella，1.45%-11.91%）和新鞘氨醇杆菌（Novosphingobium，0-5.34%）是中游的优势菌，红细菌属（Rhodobacter，12.73%~57.52%）是下游水样和水库水样中的优势菌。在AMD的影响下，造成不同地点浮游细菌群落组成差异的环境因素是不同的，流入盆地水体中的细菌群落主要受NH4＋氮、总磷（TP）和SO42-的影响，Mg2＋和As3+也与流入盆地水体中的细菌多样性有一定的相关性，水库水体中的细菌群落主要受水温（T）的影响。研究结果将有助于为酸性矿山废水资源和生态环境的研究提供理论依据